Las farmacéuticas invierten un promedio de diez años y 1.300 millones de dólares en desarrollar un nuevo medicamento. Este alto costo ha guiado a muchas empresas a concentrar sus esfuerzos en enfermedades que afectan a países de altos ingresos, dejando atrás a aquellos de ingresos bajos y medianos. Frente a este desafío, las inversiones en modelos de inteligencia artificial y aprendizaje automático (AI/ML) para la descubrimiento de fármacos han incrementado considerablemente en los últimos cinco años. Estos modelos permiten a los científicos reducir el tiempo de investigación y desarrollo al identificar mejor los posibles medicamentos. No obstante, el acceso a estos modelos suele estar limitado por la falta de expertos en ciencia de datos y recursos computacionales.
La iniciativa sin fines de lucro Ersilia Open Source Initiative busca resolver este problema con su Ersilia Model Hub, una plataforma que proporciona modelos de AI/ML y potencia computacional para investigadores dedicados al descubrimiento de fármacos contra enfermedades infecciosas en regiones fuera de Europa y América del Norte. El Hub funciona como una colección curada de modelos relevantes para el desarrollo de antibióticos, ofreciendo acceso gratuito a través de repositorios públicos en GitHub, reduciendo la brecha para investigadores de países con recursos limitados.
Ersilia fue fundada por Miquel Duran-Frigola, Gemma Turon y Edo Gaude, tres expertos en biomedicina, con el objetivo de satisfacer la necesidad crítica de herramientas de ciencia de datos en diversas instituciones y países. Actualmente, el hub contiene aproximadamente 150 modelos computacionales que son significativamente más económicos de ejecutar en comparación con los experimentos de laboratorio, proporcionando una base sólida para la investigación en el descubrimiento de fármacos.
La iniciativa colabora estrechamente con el Centro de Descubrimiento y Desarrollo de Medicamentos Holísticos (H3D) de la Universidad de Ciudad del Cabo y el Centro de Descubrimiento de Medicamentos de la Universidad de Buea en Camerún, el cual recibió financiamiento inicial de la Fundación Bill y Melinda Gates. Estos centros, al aprovechar las herramientas proporcionadas por Ersilia, buscan avanzar en la innovación en el descubrimiento de medicamentos en el continente africano.
El modelo de operaciones de Ersilia, desarrollado en colaboración con ingenieros de GitHub, permite a los investigadores acceder y utilizar los modelos disponibles a través de una interfaz sencilla que aprovecha GitHub Actions. Esto no solo automatiza el proceso, sino que también minimiza la necesidad de mantenimiento técnico por parte del equipo de Ersilia, permitiendo que se concentren en la expansión de la plataforma y en satisfacer las necesidades de sus usuarios.
En el futuro, Ersilia aspira a expandir aún más su red y mejorar la confianza en sus modelos, buscando crear una métrica de confianza y recopilar datos sobre las moléculas candidatas que se prueban. Esto podría permitir la identificación y reutilización de medicamentos existentes para tratar otras enfermedades, maximizando recursos y reduciendo la necesidad de desarrollar nuevos fármacos desde cero.
vía: Github Open Source
