Si buscas un modo sencillo para editar o crear iconos personalizados echa un vistazo a IcoFX, una aplicación gratuita solo para Windows.
IcoFX tiene soporte de múltiples resoluciones además de transparencias, puedes crear iconos redimensionables para aplicaciones que estés desarrollando o simplemente modificar los que ya tengas.
Luego, una vez editado o creado, puedes exportar el icono ya sea en formato para Windows o Mac. El software te ofrece herramientas básicas de edición, aunque también puedes importar imágenes de otros programas como Photoshop o Illustrator.
IcoFX mantiene las transparencias e incluso te permite hacer mapas de color y cambios de tamaño. También dispones de herramientas de gestión de iconos en proceso por lotes y un editor de recursos para poder cambiar los iconos incluidos en los ficheros binarios.
Sitio oficial | IcoFX